港大團隊研計算工具 如拼圖識別分組 冀助解決病毒細菌耐藥性
2025年04月16日 15:50
東網電視
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港大工程學院發表一項微生物「抗生素抗性基因」追蹤工具。
病毒、細菌不斷演變,部分更已經對抗生素產生「抗生素抗性基因」(ARGs),威脅抗生素治療成效。香港大學工程學院今日(16日)公布,學院的研究團隊成功開發名為「Argo」的計算工具,透過採用「長讀長測序」方式,能精準追蹤環境樣本中的ARGs,有助進行實時監測並能掌握其傳播途徑,以制定相應預防措施。
張彤指出,目前常用的基因定序技術是「短讀長測序」,可識別的基因讀段約為150個鹼基對,但此方式難以獲取ARGs宿主信息,難以進行風險評估及傳播追蹤。而新技術「Argo」則採用「長讀長測序」方式,可識別由1,000至20,000個鹼基對組成的基因讀段,能快速識別及量化環境宏基因組中的ARGs。
負責領導研究的工程學院土木工程系教授張彤形容,新計算工具的過程就像「拼圖遊戲」中,按「顏色」為拼圖分類,研究人員會先按照共同特徵為基因讀段碎片分組,以更容易識別其位置,且其錯誤分類比率更低。團隊期望,新技術未來能幫助應對微生物耐藥性(AMR)的全球問題。