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6个种子基金预计在年中回拨约615亿港元予政府帐目。
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虽然新一份《财政预算案》预计2024/25年度的财政赤字为872亿港元，但外界指若计及1,300亿港元发债及从未来基金和防疫抗疫基金合共回拨的900亿港元，实质财赤近3,000亿港元。政府预计今年中把6个种子基金约615亿元未需动用的馀额回拨政府帐目，同时亦预留149亿港元作为未来5年的开支，当中5个属于教育范畴，而其中研究基金回拨高达400亿港元，医管局公私营协作基金则回拨约86亿港元。因应种子基金的整体财务安排有待检讨，当局暂缓20亿港元设教师专业发展基金。
新一份预算案提出把6个种子基金结馀回拨政府帐目。政府提交立法会财经事务委员会的文件指出，政府帐目外为特定目的设立基金，现时这类基金共有42个，截至 2023/24年度的年终结馀约1,780亿港元，当中23个基金以种子基金模式运作，即只利用投资收益应付其开支。
文件指种子基金的运作模式导致巨额公共财政资源被锁起，限制政府按现时工作优次将资源投放到不同政策范畴的灵活性。为使政府可更灵活及有效运用公共财政资源，政府已检视这些基金的财务安排，并选取了6个规模较大的种子基金回拨结馀，包括研究基金、语文基金、学生活动支援基金、资历架构基金及资优教育基金，结馀回拨约615亿港元。当中以研究基金回拨的款额最高，超过400亿港元，而医管局公私营协作基金则回拨约86亿港元，语文基金亦涉及逾62亿港元回拨。
选定这6个种子基金，政府指主要考虑到它们并非根据法例规定成立，而基金的本金只涉及政府注资，不涉及捐款，因此需要修订的财务安排及回拨结馀的程序相对简单，而6个种子基金的本金均存放于外汇基金作投资，以赚取投资收益应付开支。政府将在 2028年检视6个种子基金的财务安排，并因应最新发展 及当时的政府财政情况决定5年期后的财务安排，以持续推动相关政策工作。
政府检视6个种子基金最新的财政状况，并参考相关基金的过往开支及已计划的项目，推算未来5年的现金流需求共约149亿港元，并预计今年年中把6个基金共约615亿港元的未需动用结馀回拨到政府帐目。教育局及相关政策局分别已就该6个种子基金的修订财务安排谘询相关基金监管架构。
若获财经事务委员会支持，政府会征求财委会批准，修订6个种子基金的财务安排，容许基金直接动用本金应付未来5年的工作。政府亦已要求各相关政策局就其他36个基金的财务安排展开检讨，各政策局将逐一检视其辖下基金的政策目标、财务安排、未来数年的现金流需求等。政府会因应各基金的实际情况，包括财务安排是否受法例所限、基金是否包括政府注资以外的款项等，考虑是否进行资金回拨，计划在2026年第一季完成相关检讨。
去年施政报告宣布拨款20亿港元设立教师专业发展基金，支持教师专业长远发展，持续优化教师培训及交流项目。教育局建议为此设立种子基金，并曾于去年11月谘询立法会教育事务委员会，考虑到种子基金的整体财务安排有待检讨，而教育局在2027/28 学年前仍可继续以现有资源支持相关教师专业发展措施，故教育局进一步审视教师专业发展基金的财务安排，并适时就拨款建议谘询立法会。
